MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori OK310 plasmid pHPOK310 DNA

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020556	ATT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020556	CTTG	2	8	94	101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020556	ACA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020556	GCG	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020556	AG	3	6	134	139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020556	CAA	2	6	277	282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020556	CTT	2	6	306	311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020556	GCTT	2	8	366	373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020556	A	6	6	494	499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020556	AAT	2	6	821	826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020556	CAAC	2	8	846	853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020556	A	8	8	854	861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020556	CAAG	2	8	882	889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020556	TGTT	2	8	909	916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020556	A	6	6	932	937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020556	AGA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020556	TGA	2	6	1006	1011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020556	CAA	2	6	1072	1077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020556	GAA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020556	GT	3	6	2053	2058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020556	T	6	6	2209	2214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020556	CTA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020556	TTA	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020556	TGAA	2	8	2335	2342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020556	TC	3	6	2348	2353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020556	T	6	6	2433	2438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020556	CA	3	6	2491	2496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020556	T	7	7	2513	2519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020556	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020556	T	7	7	2550	2556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020556	T	6	6	2562	2567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020556	TCTT	2	8	2570	2577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020556	TG	3	6	2585	2590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020556	T	7	7	2635	2641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020556	ATTG	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020556	A	6	6	2686	2691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020556	A	6	6	2704	2709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020556	GAAA	2	8	2749	2756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020556	A	7	7	2754	2760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020556	TGAC	2	8	2766	2773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020556	A	6	6	2781	2786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020556	CTGA	2	8	2798	2805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020556	A	6	6	2810	2815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020556	T	6	6	2836	2841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020556	T	7	7	2866	2872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020556	ATTG	2	8	2880	2887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020556	TTG	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020556	A	6	6	2965	2970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020556	A	6	6	3215	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020556	CTAAAA	2	12	3224	3235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020556	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020556	TTA	2	6	3270	3275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020556	AAC	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020556	TGT	2	6	3292	3297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020556	GC	4	8	3317	3324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020556	GA	3	6	3329	3334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020556	CTT	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020556	CTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020556	CTT	2	6	3452	3457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020556	CTT	2	6	3474	3479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020556	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020556	CTT	2	6	3518	3523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020556	ATT	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020556	AAC	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020556	CAA	2	6	3607	3612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020556	TTG	2	6	3636	3641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020556	GGA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020556	AG	3	6	3661	3666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020556	TAT	2	6	3703	3708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020556	TTA	2	6	3758	3763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020556	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020556	TA	3	6	3845	3850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020556	ATT	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020556	AGA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020556	CAA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020556	ACC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020556	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020556	AAC	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020556	CAA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.